El sistema inmune protege al organismo de células extrañas. Los linfocitos y los anticuerpos son los encargados de reaccionar ante virus, bacterias , parásitos, etc. En ocasiones el sistema inmune falla y ataca a las células propias, hablamos de enfermedades autoinmunes. En el embarazo sucede algo único el sistema inmunólogico de la madre acepta las células extrañas del embrión sin atacarlas. Cuando las rechaza y ataca se produce un aborto. El Síndrome Antifosfolipídico es el único trastorno autoinmune que explica el 15% de los diagnósticos de aborto recurrente y las pacientes no tratadas tienen un riesgo de aborto tras el diagnostico de un 90%.